学校现有学生公寓38栋：包括舟海学生公寓区、英华学生公寓区、海华学生公寓区、文华学生公寓区。其中，海华学生公寓区主要供航海类专业本科学生居住，其他公寓区主要供非航海类专业本科学生及硕士、博士研究生居住。
学生公寓环境优雅、设施齐全，为标准化四人间。室内配有电脑桌、衣柜、书架、阶梯鞋柜、储物箱及床铺，阳台统一装有晾衣架，便于学生晾晒衣物。公寓每层设有公共洗漱间、洗手间；配备全自动自助式洗衣机和热水供应机，学生日常生活便捷；装有有线网络端口和无线信号增强器，网络连接快速高效。公寓每天有专人清理卫生，楼内环境干净整洁。
此外，海大部分公寓阳台可以远眺大海，被校友调侃为“海景房”，住宿体验与众不同。
